В СССР советского разведчика-британца доставил из Ливана сухогруз «Долматов». Свою квартиру в Бейруте Филби пришлось покинуть стремительно, под предлогом необходимости «встречи с контактом» — он работал корреспондентом британских изданий «Обсервер» и «Экономист».
В начале 1960-х годов британская контрразведка MI-5 все ближе подбиралась к Киму: компрометирующие его сведения накапливались из различных источников. К январю 1963 года над Филби нависла реальная угроза провала и ареста, и Центр принял решение переправить уникального агента в Советский Союз.
Под подозрения Ким Филби попал ещё в 1951 году, после побега товарищей по «пятёрке» Дональда Маклейна и Гая Бёрджесса в СССР. Его уволили из британской разведки (MI6), но в ноябре 1955 года подозрения в том, что он был «третьим человеком», были официально сняты.
С помощью личных связей и связей отца, и при содействии бывших коллег по разведке Филби удалось получить назначение в Бейрут. В июле 1956 года Ким прибыл в столицу Ливана, где старые соратники по MI6 активно использовали его в качестве фрилансера, но в то же время внимательно за ним присматривали совместно с ЦРУ. Но даже в таких нелёгких условиях Филби сумел восстановить контакт с сотрудниками советской разведки и умудрялся передавать им ценную информацию, и не только по ситуации на Ближнем Востоке.
Последующая четверть века в Советском Союзе стала активным продолжением его служения советской разведке. Филби выступал в роли консультанта и аналитика по вопросам противодействия западным спецслужбам, была создана своеобразная «школа» для молодых оперативных работников, готовящихся к выезду в Великобританию. Ким был счастливо женат на русской женщине Руфине и о периоде своего пребывания в Москве говорил: «Могу сказать с уверенностью, что закат моей жизни - золотой!».